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    讓基因表達分析更快更便宜的方法
    2015-8-18
    來源:互聯網
    點擊數: 6741          作者:未知
    • 最近,耶魯大學的一個研究團隊,開發了一種簡單的方法,能明顯降低大規?;虮磉_分析的時間和成本。相關研究結果三月二日發表在Nature旗下子刊《自然方法》(Nature Methods)。該研究團隊由耶魯醫學院放射治療學助理教授、醫學博士Abhijit Patel帶領,他們創建了一種工具,利用新一代高通量DNA測序技術,使我們能夠更容易的同時測量大量細胞或組織中的基因活性。而DNA被認為是生命的藍圖,知道在不同條件下哪些基因被激活或關閉,是我們理解生物學和疾病的基礎。

      這種方法稱為模塊化早期標記擴增(meta)RNA譜,可以在許多樣本中同時量化各種microRNA或mRNA,而且比現有的數字分析技術需要更少的測序深度。這種方法可在反轉錄過程中分配定量標簽,以在競爭性擴增和深度測序之前使前期樣本混合。這種簡單的、可擴展的、便宜的方法,提高了大規?;虮磉_研究的實用性。

      基因表達分析是臨床試驗中常用的。例如,在乳腺癌患者中,往往通過檢測腫瘤標本中的基因表達來預測復發的可能性,以確定化療是否是有益的。Patel說,另外有研究驗證,這種高通量的方法可用來同時測量許多患者腫瘤的基因表達。最后,該方法能夠減少這種檢測的成本,使他們更加的廣泛可用。

      本文資深作者Patel說:“為了得出關于復雜基因表達模式的有意義的結論,通常需要對大量的臨床或實驗樣品進行統計分析。我們相信,這項新技術將有助于此類工作的開展。我們很興奮,因為這種方法使得大規模RNA譜研究更加實用,并且更容易為大多數研究人員和臨床實驗室所用?!?

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